同一樣本可以多次做原位雜交實(shí)驗(yàn)嗎?
一般情況下,如果操作沒(méi)有得到理想的結(jié)果,是可以將探針洗滌然后進(jìn)行再次的雜交的。如果使用的是直標(biāo)型探針,還可以使用不同探針對(duì)同一樣本進(jìn)行反復(fù)雜交。針對(duì)不同的樣本,處理方法略有不同。
原位雜交實(shí)操中哪些因素比較重要?
重要的因素:溫度、光照、濕度和試劑的PH值。溫度和濕度直接影響著探針和目標(biāo)DNA的雜交效率;光照影響著熒光染料的強(qiáng)度,所以探針要避光保存,其已經(jīng)雜交的片子可用防熒光淬火劑封片且避光保存;各種試劑pH也要達(dá)到要求,這也直接關(guān)系到原位雜交的穩(wěn)定性。
一. 原位雜交天
1. 重新水化和固定
1) 吸取固定好的胚胎,加入50%的PBST溶液,放置5分鐘。
2) 置換成30%的PBST溶液,放置5分鐘
3) 置換成PBST溶液,放置5分鐘,重復(fù)一次
4) 置換成4%多聚甲醛的PBS溶液固定20分鐘
5) 用PBST洗兩次,每次放置五分鐘,室溫。
蛋白酶處理與后固定(本實(shí)驗(yàn)不做此步)
1) 用10ul/ml的蛋白酶K在室溫下處理胚胎。5體節(jié)以下的胚胎不處理,5體節(jié)到24小時(shí)的胚胎處理3分鐘,24小時(shí)以上的胚胎處理5分鐘或者更長(zhǎng)。發(fā)育時(shí)間越短的胚胎越嫩,可以不用或者少用蛋白酶處理,發(fā)育時(shí)間長(zhǎng)的胚胎就需要用蛋白酶來(lái)疏松組織,以便于雜交。
2) 用PBST溶液輕洗,在PBST中放置5分鐘。
3) 用4%多聚甲醛的PBS溶液固定20分鐘,室溫。
4) 用PBST洗兩次,每次放置五分鐘,室溫。
原位雜交第二天
1.
1)將探針回收,放于-20C保存(通常探針可重復(fù)使用十次左右)。
2)加入50%甲酰胺/2XSSCT溶液1毫升,60℃,放置30分鐘,重復(fù)一次。
3)置換2XSSCT1ml,60℃,放置15分鐘。
4)置換0.2XSSCT1ml,60℃,放置30分鐘,重復(fù)一次。
2.
1)用MABT洗兩次,每次五分鐘,放在搖床輕輕搖動(dòng)。
2)室溫下加1ml 1:2:7溶液,時(shí)間為一小時(shí)。
3)按1:3000的比例在1:2:7溶液中加入酶連,4C 冰箱過(guò)夜。
植物染色體原位雜交是一種重要的分子生物學(xué)技術(shù),它可以用來(lái)研究植物基因組的結(jié)構(gòu)和功能。該技術(shù)利用DNA探針與目標(biāo)DNA序列的互補(bǔ)性結(jié)合,通過(guò)熒光或性標(biāo)記來(lái)檢測(cè)目標(biāo)DNA序列在染色體上的位置和數(shù)量。
植物染色體原位雜交技術(shù)的基本原理是將DNA探針標(biāo)記上熒光或性同位素,然后將其與目標(biāo)DNA序列進(jìn)行雜交。在雜交過(guò)程中,探針與目標(biāo)DNA序列互補(bǔ)結(jié)合,形成穩(wěn)定的雙鏈DNA分子。隨后,通過(guò)熒光或性同位素探測(cè)技術(shù),可以檢測(cè)到目標(biāo)DNA序列在染色體上的位置和數(shù)量。