孤獨癥兒童的訓練目標是教會他們一些有用的社會技能，如生活處理能力，如與人交往的方式和技巧，與周圍環境協調的能力等。這里主要涉及到的是社會教育環境。因此首先盡量為孤獨癥兒童提供較好的課堂教學環境，因為當一個孩子被診斷為“孤獨癥”后，即使他（她）有一個良好的家庭環境，但如果被排斥在同齡伙伴的集體之外，獲得良性發展的前景依然是渺茫的。

對能力不同的孤獨癥兒童應制訂不同的認知心理干預方案。認知是人與人溝通的基礎，也是一個人的基本能力，大多數孤獨癥兒童存在著認知障礙，但不是所有的孤獨癥兒童的障礙都相同，有的平衡能力差，有的感知覺能力差，有的聽力不太好等等，對于這些并不能千篇一律的采用一種訓練方法，例如其注意聽的能力很差，那么也就無法適應課堂教學，就應在注意聽、聽的記憶、聽的敏銳度等方面進行訓練。對于一些孩子的特殊能力應加以引導訓練，例如有的孩子很有畫畫天賦，家長及教師就應在這方面多給予孩子鼓勵。因此，在制定訓練目標時，應根據其心理發展水平，本著從簡單到復雜，從具體到抽象的認知規律進行。

和諸多精神類疾病，如、癥及雙向等一樣，對自閉癥的診斷目前還只能依賴于臨床醫生的主觀判斷。盡管已經有較確鑿的證據表明自閉癥與遺傳因素關系十分密切，遺傳學家對自閉癥數十年的研究發現，與自閉癥有關的基因多達上百個，說明自閉癥并不是單一基因致病的疾病。在對自閉癥相關基因的研究中，有幾類與自閉癥關系密切的基因及其編碼蛋白初都是由生物化學家首先發現的，這些生物化學家進而從生物化學逐漸過渡到神經生物學研究領域，為自閉癥的神經生物學研究做出了重要貢獻。