如果船舶在營運過程中安排人工清洗油艙，船長應首先考慮到人員進入密閉艙室的安全問題。提前預訂添加劑，并確保計劃執行燃油艙清潔的輪機長和輪機員知道如何正確使用添加劑。與租家及時溝通，為聘請工程隊清洗合理安排好船期。進入程序必須遵守國際海事組織第A.1050(27)號決議關于《進入船上密閉艙室的建議案》中的安全措施。

清洗過程中也可以同時檢查油艙結構、加熱系統以及進行壓力測試等。船東需要考慮使用其他的替代方法進行燃油艙和管路的清洗。目前除了進船塢清洗外，還有在營運期間清洗及使用添加劑進行清洗兩種辦法。一些航運公司在更換使用燃油艙之前會使用化學添加劑進行清洗。實踐證明，這是減少清洗油艙非常有效和經濟的方式之一。

定期清洗船舶燃油艙安全有效的方法是安排船舶進塢徹底檢查和清洗，短期內安排全球所有正在使用HSFO的船舶進船塢清洗燃油艙并不現實。清洗所需時間將取決于油艙的數量和大小，以及上次清洗的時間間隔和人員安排。船東需要考慮使用其他的替代方法進行燃油艙和管路的清洗。目前除了進船塢清洗外，還有在營運期間清洗及使用添加劑進行清洗兩種辦法。

油艙在清洗之前需要排空，這段時間也應計算在內，且沖洗船上燃油系統管路還需要1-2天。油艙清洗后的殘余物應通過正確方式排放或由港口接收設施處理。殘留物通常也會凝固并沉淀在燃油系統的各個部分，包括管道、沉淀柜和日用柜。清洗方法所用時間是基于航運實踐的經驗總結，并不一定適用于每一船舶。IMO也表示，船舶為滿足0.50%m/m含硫量上限而備艙所需的時間和工作量難以預估。